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      單細(xì)胞和微量細(xì)胞甲基化測序技術(shù)

      參考價(jià)面議
      具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
      • 公司名稱深圳市易基因科技有限公司
      • 品       牌
      • 型       號(hào)
      • 所  在  地深圳市
      • 廠商性質(zhì)經(jīng)銷商
      • 更新時(shí)間2018/10/9 10:27:57
      • 訪問次數(shù)1174
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      深圳市易基因科技有限公司(E-GENE)是位于坪山區(qū)的國家*。公司致力于以表觀遺傳學(xué)為核心的技術(shù)與產(chǎn)品開發(fā),涵蓋高通量測序、體外診斷和生命科學(xué)研究等領(lǐng)域。公司自主開發(fā)的血漿游離DNA甲基化高通量測序文庫試劑盒、靶向血漿游離DNA甲基化測序技術(shù)等,將為廣大有志于開發(fā)復(fù)雜疾病血漿游離DNA甲基化生物標(biāo)志物的科研院所、醫(yī)院和公司提供有效工具。同時(shí),公司提供表觀基因組學(xué)相關(guān)的科學(xué)研究服務(wù)和生命科學(xué)研究產(chǎn)品,致力于推動(dòng)人、動(dòng)植物及微生物領(lǐng)域的表觀基因組學(xué)研究和應(yīng)用。公司科研服務(wù)團(tuán)隊(duì)在復(fù)雜疾病多組學(xué)關(guān)聯(lián)及比較、病原微生物-宿主相互作用機(jī)制、模式動(dòng)植物多組學(xué)等方面的研究積累了豐富經(jīng)驗(yàn)。公司已經(jīng)與國內(nèi)多家企業(yè)和單位建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系,共同致力于為生物醫(yī)藥領(lǐng)域和生命科學(xué)研究提供性能*的產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

      高通量測序、體外診斷和生命科學(xué)研究等領(lǐng)域
      單細(xì)胞和微量細(xì)胞甲基化測序技術(shù) 是運(yùn)用線性擴(kuò)增技術(shù),對單個(gè)細(xì)胞基因組DNA的甲基化水平進(jìn)行單堿基精確檢測。分離單細(xì)胞后,將細(xì)胞用特殊的裂解液進(jìn)行裂解,并直接進(jìn)行重亞硫酸鹽處理進(jìn)行轉(zhuǎn)換。轉(zhuǎn)換后的DNA作為模板,經(jīng)隨機(jī)引物擴(kuò)增后進(jìn)行高通量測序,檢測全基因組的甲基化水平。
      單細(xì)胞和微量細(xì)胞甲基化測序技術(shù) 產(chǎn)品信息

      單細(xì)胞和微量細(xì)胞甲基化測序技術(shù)是運(yùn)用線性擴(kuò)增技術(shù),對單個(gè)細(xì)胞基因組DNA的甲基化水平進(jìn)行單堿基精確檢測。分離單細(xì)胞后,將細(xì)胞用特殊的裂解液進(jìn)行裂解,并直接進(jìn)行重亞硫酸鹽處理進(jìn)行轉(zhuǎn)換。轉(zhuǎn)換后的DNA作為模板,經(jīng)隨機(jī)引物擴(kuò)增后進(jìn)行高通量測序,檢測全基因組的甲基化水平。

      單細(xì)胞和微量細(xì)胞甲基化測序技術(shù)該技術(shù)可應(yīng)用于研究單個(gè)細(xì)胞內(nèi)的基因組甲基化圖譜,對胚胎發(fā)育、腫瘤干細(xì)胞等微量或異質(zhì)性細(xì)胞的甲基化研究提供有力的研究策略。單細(xì)胞RRBS測序(scRRBS)是將單細(xì)胞分離后,通過單管酶反應(yīng),將細(xì)胞裂解后的基因組DNA連接接頭,特異性的檢測單個(gè)細(xì)胞的CpG島和啟動(dòng)子等區(qū)域的甲基化信息。該技術(shù)可運(yùn)用于胚胎發(fā)育、腫瘤干細(xì)胞等微量或異質(zhì)性細(xì)胞的甲基化研究。微量甲基化測序是指對5-10ng的基因組DNA或片段化的DNA,進(jìn)行全基因組甲基化檢測的技術(shù)。微量DNA樣本的甲基化測序技術(shù)可應(yīng)用于病灶組織、FFPE樣本和cell-free DNA甲基化檢測分析。

      數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

      1. 基本數(shù)據(jù)處理:
        • 原始數(shù)據(jù)評(píng)估,去除接頭與過濾低質(zhì)量數(shù)據(jù);
        • reads數(shù)量以及數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)。
      2. 基礎(chǔ)生物學(xué)信息分析:
        • 將測序數(shù)據(jù)與參考基因組比對,統(tǒng)計(jì)比對結(jié)果;
        • 基于比對結(jié)果,統(tǒng)計(jì)各C位點(diǎn)的甲基化修飾信息;
        •  測序數(shù)據(jù)的堿基覆蓋深度及覆蓋度統(tǒng)計(jì);
        • 胞嘧啶(CG、CHG、CHH)甲基化水平統(tǒng)計(jì);
        •  基因組甲基化分布及修飾特征分析;
      3. 高級(jí)生物學(xué)信息分析:
        •  結(jié)合項(xiàng)目背景的差異甲基化修飾位點(diǎn)(DMS)的鑒定、注釋和分布分析;
        • 結(jié)合項(xiàng)目背景的差異甲基化修飾區(qū)域(DMR)的鑒定、注釋和分布分析;
        • 結(jié)合項(xiàng)目背景的差異甲基化修飾基因的功能、通路和疾病等富集分析;
        • 結(jié)合項(xiàng)目背景,與其他多組學(xué)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析。

      樣本要求

      1. 細(xì)胞分離:由合作方完成單細(xì)胞分離;
      2. 樣品要求:單個(gè)細(xì)胞染色質(zhì)DNA量在0.5 pg-1 ng的范圍,單細(xì)胞樣本體積以不超過2μl;
      3. 單細(xì)胞送樣量:單細(xì)胞基因組擴(kuò)增,建議重復(fù)單細(xì)胞樣本個(gè)數(shù)不小于3個(gè);
      4. 微量樣本DNA送樣要求:單個(gè)樣本DNA量≥5ng,體積不超過30μl,無污染;
      5. 樣品寄送:*使用0.2mL平蓋PCR管收集樣品。用Parafilm封口膜纏繞封口,裝入PCR管盒,橡皮筋固定,再裝入自封袋,大體積干冰運(yùn)輸
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