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      真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)

      參考價面議
      具體成交價以合同協(xié)議為準(zhǔn)
      • 公司名稱深圳市易基因科技有限公司
      • 品       牌
      • 型       號
      • 所  在  地深圳市
      • 廠商性質(zhì)經(jīng)銷商
      • 更新時間2018/10/9 10:23:33
      • 訪問次數(shù)1264
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      深圳市易基因科技有限公司(E-GENE)是位于坪山區(qū)的國家*。公司致力于以表觀遺傳學(xué)為核心的技術(shù)與產(chǎn)品開發(fā),涵蓋高通量測序、體外診斷和生命科學(xué)研究等領(lǐng)域。公司自主開發(fā)的血漿游離DNA甲基化高通量測序文庫試劑盒、靶向血漿游離DNA甲基化測序技術(shù)等,將為廣大有志于開發(fā)復(fù)雜疾病血漿游離DNA甲基化生物標(biāo)志物的科研院所、醫(yī)院和公司提供有效工具。同時,公司提供表觀基因組學(xué)相關(guān)的科學(xué)研究服務(wù)和生命科學(xué)研究產(chǎn)品,致力于推動人、動植物及微生物領(lǐng)域的表觀基因組學(xué)研究和應(yīng)用。公司科研服務(wù)團隊在復(fù)雜疾病多組學(xué)關(guān)聯(lián)及比較、病原微生物-宿主相互作用機制、模式動植物多組學(xué)等方面的研究積累了豐富經(jīng)驗。公司已經(jīng)與國內(nèi)多家企業(yè)和單位建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系,共同致力于為生物醫(yī)藥領(lǐng)域和生命科學(xué)研究提供性能*的產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

      高通量測序、體外診斷和生命科學(xué)研究等領(lǐng)域
      真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)是針對真核生物特定組織或細胞在某個特定時期轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA進行測序。既可研究已知基因,亦能發(fā)掘新基因,全面快速地獲得mRNA序列和豐度信息。
      真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù) 產(chǎn)品信息

      真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)是針對真核生物特定組織或細胞在某個特定時期轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA進行測序。既可研究已知基因,亦能發(fā)掘新基因,全面快速地獲得mRNA序列和豐度信息。可以分為:有參考轉(zhuǎn)錄組和無參考轉(zhuǎn)錄組測序。

      真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

      1. 有參轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)信息分析
        • 對原始數(shù)據(jù)進行去除接頭、污染序列及低質(zhì)量reads的處理
        • 測序評估:比對統(tǒng)計、測序隨機性評估、比對上序列在染色體的分布、比對上序列在基因區(qū)域的分布、比對結(jié)果可視化
        • 基因表達注釋:基因表達量、表達量分布、樣品聚類
        • 基因差異表達分析
        • 差異基因表達模式聚類分析
        • 差異表達基因GO功能顯著性富集分析:GO子類統(tǒng)計、GO富集分析、富集GO q值分布
        • 差異表達基因Pathway顯著性富集分析:KO富集分析、富集KO q值分布、通路結(jié)果注釋
        • 基因的可變剪接分析:可變剪接鑒定、統(tǒng)計、表達量分析
        • 預(yù)測新轉(zhuǎn)錄本:新轉(zhuǎn)錄本注釋、表達量統(tǒng)計、差異分析
        • SNP分析
        • 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析
      2. 無參轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)信息分析
        • 對原始數(shù)據(jù)進行去除接頭、污染序列及低質(zhì)量reads的處理
        • 數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計及測序數(shù)據(jù)的堿基含量和質(zhì)量評估
        • 組裝結(jié)果分析:組裝結(jié)果統(tǒng)計及轉(zhuǎn)錄本長度分布
        • 組裝結(jié)果評估:
          • 比對率分析、均一性分析
          • 組裝準(zhǔn)確性評估、組裝結(jié)果注釋比例評估、Reads利用率及嵌合體比例評估、核心蛋白比率評估。
        • 預(yù)測編碼蛋白框(CDS)
        • Unigene功能注釋
        • Unigene的COG分類
        • Unigene的GO分類
        • Unigene代謝通路分析
        • Unigene表達量分析:Unigene的表達量估計及其分布統(tǒng)計,實驗樣品的聚類
        • Unigene表達差異分析
        • 差異表達的Unigene結(jié)果統(tǒng)計:數(shù)目統(tǒng)計、聚類分析、組間差異表達的Unigene分布統(tǒng)計
        • 差異表達的Unigene GO分類和Pathway富集性分析
        • 差異表達的Unigene功能注釋
        • SNP分析
        • SSR分析與引物設(shè)計。

      樣本要求

      1. 樣品類型:完整且無污染的總RNA;
      2. 樣品需求量(單次):200 ng; 2ug(真菌)
      3. 樣品濃度:≥20ng/μL;≥40ng/μL(真菌)
      4. 樣品純度:28S:18S≥1.0;RIN≥7.0(動物);RIN≥6.5(植物&真菌);昆蟲樣品無28S:18S及RIN值要求
      5. 樣品OD值: 260/280≥1;260/230≥1.8;昆蟲和動物樣品無OD值要求
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