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應(yīng)用基因表達(dá)譜芯片研究人腹主動脈瘤細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡相關(guān)基因
目的篩選腹主動脈瘤發(fā)生過程中與正常組織差異表達(dá)的細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡相關(guān)基因并作初步功能分析. 方法應(yīng)用Trizol一步法抽提2塊腹主動脈瘤壁及2塊正常主動脈組織總RNA后,Oligotex mRNA Spin-Column操作法分離純化組織mRNA;經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄合成熒光分子(Cy3/Cy5)標(biāo)記cDNA探針,與微矩陣排列的含有4 096種cDNA基因的表達(dá)譜芯片雜交,利用GenePix Pro 3.0軟件分析動脈瘤與正常組織中差異表達(dá)的基因,對所獲得的基因進(jìn)行分子生物信息學(xué)分析. 結(jié)果腹主動脈瘤與正常組織間差異表達(dá)的細(xì)胞周期和應(yīng)用基因表達(dá)譜芯片研究人腹主動脈瘤細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡相關(guān)基因
細(xì)胞凋亡基因有18條,占芯片基因總數(shù)的0.44%.其中與細(xì)胞周期相關(guān)的基因11條,與細(xì)胞凋亡相關(guān)的基因7條.在動脈瘤組織中表達(dá)上調(diào)的基因9條,平均Ratio值為3.860,表達(dá)下調(diào)的9條,平均Ratio值為0.294.生物信息學(xué)分析顯示,該18條差異表達(dá)細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡基因與腹主動脈瘤中平滑肌細(xì)胞的生長和凋亡有關(guān). 結(jié)論腹主動脈瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中存在多基因表達(dá)調(diào)控的改變,細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡基因與腹主動脈瘤中平滑肌細(xì)胞等的生長和凋亡有相關(guān)性,對于該相關(guān)基因群的進(jìn)一步研究有助于闡釋腹主動脈瘤的發(fā)病機(jī)制.
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