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      全基因組重測序技術(WGS)

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      • 全基因組重測序技術(WGS)

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      更新時間:2018-10-09 10:21:38瀏覽次數(shù):2011

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      產品簡介

      全基因組重測序技術(WGS)是在已有參考序列及其基因功能注釋的基礎上,對相關基因組進行重測序,尋找不同個體或處理后相對于參考基因組的差異。該技術可應用于檢測各種遺傳突變,如單核苷酸多態(tài)性SNP、體細胞突變SNV,拷貝數(shù)變異CNV等,已經成為動植物育種、群體進化、藥物研發(fā)、疾病研究和臨床診斷中較為迅速而有效的方法之一,為篩選疾病的致病和易感基因,研究發(fā)病及遺傳機制提供重要信息。

      詳細介紹

      全基因組重測序技術(WGS)是在已有參考序列及其基因功能注釋的基礎上,對相關基因組進行重測序,尋找不同個體或處理后相對于參考基因組的差異。該技術可應用于檢測各種遺傳突變,如單核苷酸多態(tài)性SNP、體細胞突變SNV,拷貝數(shù)變異CNV等,已經成為動植物育種、群體進化、藥物研發(fā)、疾病研究和臨床診斷中較為迅速而有效的方法之一,為篩選疾病的致病和易感基因,研究發(fā)病及遺傳機制提供重要信息。

      全基因組重測序技術(WGS)數(shù)據(jù)解讀分析內容:

      1. 標準信息分析
        • 去除接頭序列、低質量序列得到clean data
        • 比對,并統(tǒng)計
        • *性序列生成
        • SNP檢測、注釋及統(tǒng)計
      2. InDel 檢測、注釋及統(tǒng)計
        • SV檢測、注釋及統(tǒng)計
        • CNV檢測、注釋及統(tǒng)計
        • 根據(jù)已有數(shù)據(jù)庫的信息對表型或疾病風險進行評估
      3. 癌癥研究的高級信息分析
        • 成對的樣本(normal-tumor)SNP/InDel/SV/SNV/CNV檢測、注釋及統(tǒng)計
        • 氨基酸置換預測
        • Pathway,GO富集分析
        • 篩選出的突變與已有數(shù)據(jù)庫比較(cosmic, dbSNP, HGMD等)
        • 重排檢測及注釋
        • 選擇壓力檢測以識別出driver gene
        • Mutation target network

      樣本要求:

      1. 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
      2. 樣品需求量:≥2μg;
      3.  樣品濃度:≥50 ng/μl;
      4. 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0

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